Mejores soluciones para cobrar facturas online
Estas son las cinco opciones que más sentido nos parecen según el tipo de negocio:
- Mejor solución integral para facturar y cobrar: Holded.
- Mejor para cobrar online con flexibilidad e integraciones: Stripe Invoicing.
- Mejor para facturas recurrentes y adeudo directo SEPA: GoCardless.
- Mejor para empezar sin cuota mensual de facturación: Facturas Square.
- Mejor para autónomos que priorizan facturación adaptada a España: TeamSystem Facturas.
La diferencia importante está en qué parte del proceso quieres resolver. Holded y TeamSystem Facturas son, ante todo, programas de facturación y gestión. Stripe y GoCardless destacan más como infraestructura de cobro. Square queda en un punto intermedio, con facturación digital y cobro integrado.
Si solo necesitas facilitar el pago de una factura ya emitida, quizá te convenga comparar antes las pasarelas de pago o entender qué es un enlace de pago y cómo funciona. Comprar un software completo para resolver únicamente el último paso del cobro suele ser más de lo que muchos negocios necesitan.
Comparativa de las top soluciones para cobrar facturas online
La TAE no es una métrica aplicable en esta comparativa, porque no estamos comparando financiación. Para decidir bien importan más la cuota del software, la comisión de cobro, el método de pago, la automatización y si la herramienta puede servir como sistema de facturación en España.
| Solución | Mejor para | Cómo cobra la factura | Automatización útil | Coste de referencia | Encaje como software de facturación en España |
|---|---|---|---|---|---|
| Holded | Pymes y negocios que quieren facturación + gestión | Pago online desde la factura y métodos conectados | Conciliación, recordatorios, recurrentes y gestión integrada | Suscripción al software + condiciones del método de cobro; las comisiones del cobro propio se muestran durante la activación | El proveedor declara compatibilidad con VERI*FACTU; conviene configurar el sistema según el caso del negocio. |
| Stripe Invoicing | Negocios digitales, internacionales o con integraciones | Página de factura alojada y métodos de Stripe | Recordatorios, cobro automático, API y conciliación | Starter: 0,4 % por factura pagada, más la tarifa de Stripe Payments. Una tarjeta estándar del EEE parte de 1,5 % + 0,25 €. | Muy potente para cobrar; si será tu sistema de emisión fiscal, valida por separado los requisitos españoles que te correspondan |
| GoCardless | Cuotas, servicios periódicos y cobros recurrentes | Adeudo directo y pagos bancarios | Cobro en vencimiento, reintentos e integración con software contable | Standard: 1 % + 0,20 € por operación nacional, con máximo de 2 €. | Es principalmente una solución de cobro; normalmente se combina con tu programa de facturación |
| Facturas Square | Autónomos y pequeños negocios que quieren empezar simple | Pago online desde la factura | Facturas recurrentes, recordatorios y seguimiento | Plan Gratuito: 0 €/mes; pago online con tarjeta: 2,5 %. Plus: 20 € + IVA/mes. | Square ofrece activación de VERI*FACTU para negocios en España que lo usan como sistema principal de facturación; revisa el encaje de tu caso. |
| TeamSystem Facturas | Autónomos y pymes que priorizan emisión y control de facturas | Pasarelas integradas desde la propia factura | Recurrentes, recordatorios, seguimiento y conciliación | Básico desde 6,60 € + IVA/mes con facturación anual; 8 € + IVA con facturación mensual. El coste del cobro depende de la pasarela. | El proveedor declara adaptación a VERI*FACTU y ofrece declaración responsable. |
Hay una diferencia que puede cambiar por completo la decisión. Una comisión porcentual pesa mucho más cuanto mayor es tu factura. En un ejemplo ilustrativo de 1.000 €, Stripe Starter con una tarjeta estándar del EEE supondría 19,25 € entre Invoicing y procesamiento —4 € + 15 € + 0,25 €—, mientras que Square cobraría 25 € con su tarifa online del 2,5 %. En GoCardless Standard, un cobro nacional alcanzaría el tope de 2 €. No son métodos equivalentes: el adeudo directo tiene otra experiencia de pago, otros plazos y otras reglas. La comparación sirve para ver por qué mirar solo la cuota mensual puede llevarte a elegir mal.
Antes de contratar nada, revisa también nuestra selección de mejores enlaces de pago para negocios y la guía sobre cómo contratar una pasarela de pago. Si ya tienes un buen programa de facturación, añadir un método de cobro puede ser más barato y menos disruptivo que cambiar todo tu sistema.
Dos comprobaciones que no saltaríamos en España: si la herramienta va a generar tus facturas, confirma que el sistema y su configuración cumplen los requisitos de facturación que te afecten; la información oficial de la Agencia Tributaria sobre SIF y VERI*FACTU es la referencia que conviene revisar. Y si aceptas pagos electrónicos, no confundas comodidad con ausencia de controles: el Banco de España explica la autenticación reforzada en los pagos online y por qué puede aparecer una verificación adicional al cliente.
Holded: la opción más completa para facturar, cobrar y gestionar
Holded es nuestra elección para una pyme o un negocio de servicios que quiere tener la facturación y buena parte de la gestión en un mismo entorno. No se limita a crear documentos: incorpora facturación recurrente, recordatorios, portal de cliente, conciliación y diferentes formas de añadir el cobro online a la factura.
¿Por qué está en el ranking? Porque reduce uno de los problemas más habituales al cobrar: que la factura vaya por un lado, el pago por otro y la conciliación termine haciéndose a mano. Holded permite que el cliente pague desde el entorno de la factura y que el cobro se vincule al documento. Su documentación también contempla métodos de pago externos conectados.
Lo recomendaríamos sobre todo a agencias, consultoras, estudios y pequeñas empresas que, además de cobrar, necesitan presupuestos, facturación recurrente, seguimiento y una gestión más centralizada. Si solo emites unas pocas facturas y ya tienes resuelta la parte administrativa, puede resultar más amplio —y más caro en conjunto— de lo necesario.
Un matiz importante: las condiciones del cobro online propio no aparecen como una tarifa universal en la documentación que hemos podido verificar; Holded indica que las comisiones se muestran durante el proceso de activación. Revisa ese coste antes de decidir, especialmente si cobras importes altos.
Si tu prioridad concreta es facilitar el pago remoto, nuestra guía sobre cómo cobrar una factura con tarjeta a distancia te ayuda a separar el proceso de facturación del de cobro. También puedes contrastar Holded con las mejores pasarelas de pago para un negocio si prefieres mantener tu software y conectar una solución externa.
Puntos fuertes: enfoque integral, automatización, conciliación y buena lógica para negocios que quieren reducir trabajo administrativo. Limitación principal: si únicamente buscas cobrar facturas, puedes acabar pagando por funciones que no necesitas.
Para profundizar en sus ventajas, costes y limitaciones, consulta nuestra review de Holded.
Stripe Invoicing: la mejor para cobros online flexibles e integraciones
Stripe Invoicing está orientado a crear, enviar y cobrar facturas digitales con una infraestructura de pagos muy flexible. Permite alojar la página de pago, automatizar recordatorios y usar API si quieres conectar el cobro con tu web, CRM o procesos internos.
Su gran ventaja es que el coste escala con el uso en lugar de obligarte a una cuota fija de Invoicing: el plan Starter cobra el 0,4 % de cada factura pagada, a lo que se suma la tarifa del método de pago. En tarjetas estándar del Espacio Económico Europeo, Stripe publica 1,5 % + 0,25 €. Esto puede ser cómodo para empezar, pero en facturas elevadas conviene hacer números.
Lo recomendamos para SaaS, negocios digitales, servicios profesionales con clientes internacionales y empresas que valoran integraciones. También encaja cuando quieres que el cliente reciba una factura o solicitud de pago profesional y pueda pagar sin que tengas que montar un proceso complejo.
No sería nuestra primera opción si lo que necesitas es un programa de facturación español completo con toda la operativa fiscal y contable concentrada. Cobrar una factura y emitir correctamente el documento fiscal no son exactamente el mismo problema. Si Stripe va a formar parte de tu sistema de facturación, valida qué herramienta genera el documento oficial y cómo cumples los requisitos aplicables en España.
Para flujos sencillos, puedes ver cómo crear y enviar un enlace de pago paso a paso o cómo cobrar a distancia sin tener una web. Son dos alternativas útiles cuando no necesitas desplegar toda la capa de Invoicing.
Puntos fuertes: integraciones, alcance internacional, automatización y mucha flexibilidad técnica. Limitaciones: el coste porcentual crece con el importe cobrado y la parte fiscal española requiere revisar bien tu configuración.
Para ver el análisis completo antes de contratarlo, consulta nuestra review de Stripe.
GoCardless: la mejor para cobrar facturas recurrentes por adeudo directo
GoCardless resuelve un problema diferente: cobrar de forma recurrente de banco a banco, especialmente útil cuando tienes cuotas, mantenimientos, igualas, suscripciones o servicios mensuales. El cliente autoriza el cobro y, a partir de ahí, puedes programarlo para la fecha de vencimiento e integrarlo con tu software de facturación.
El atractivo está tanto en la automatización como en el coste. Su tarifa Standard publicada para operaciones nacionales es del 1 % + 0,20 €, con un máximo de 2 € por transacción. Para una empresa que cobra facturas de importe medio o alto todos los meses, ese tope puede marcar una diferencia importante frente a una comisión porcentual sin máximo.
Lo recomendaríamos a academias, despachos, empresas de mantenimiento, software por suscripción y servicios B2B recurrentes. En cambio, no lo elegiríamos como única solución si tus clientes esperan pagar puntualmente con un método inmediato y sin autorizar un adeudo.
Aquí hay una advertencia que merece atención: el adeudo directo SEPA tiene reglas propias de devolución. En el esquema SEPA Direct Debit Core, el pagador puede solicitar la devolución de un adeudo autorizado durante ocho semanas; para un cobro no autorizado, el plazo puede llegar a trece meses. Automatizar el cobro no elimina el riesgo de devoluciones, así que conviene conservar bien el mandato y la documentación del servicio. Puedes consultar las .
Puntos fuertes: coste competitivo en importes altos, automatización de cobros periódicos e integración con programas de gestión. Limitaciones: no sustituye por sí solo a un software de facturación y el adeudo directo no tiene la misma experiencia que un pago puntual online.
Si te interesa valorar el servicio con más detalle, consulta nuestra review de GoCardless.
Facturas Square: la mejor para empezar sin cuota mensual de facturación
Facturas Square destaca por una propuesta fácil de entender: puedes crear y enviar un número ilimitado de facturas con el plan Gratuito y pagar cuando el cliente abona online. Incluye facturas recurrentes, recordatorios automáticos y seguimiento del estado; el plan Plus añade funciones más avanzadas.
Para pagos online desde una factura, Square publica una comisión del 2,5 %. Esto hace que sea atractiva para quien quiere evitar una cuota fija, pero no significa que vaya a ser la opción más barata a medida que suba el volumen o el importe medio de las facturas. Con 10 facturas de 1.000 € cobradas online, por ejemplo, un 2,5 % serían 250 € en comisiones. Es un ejemplo matemático, no una estimación de tu coste total.
La vemos especialmente adecuada para freelancers y pequeños negocios con cobros puntuales que valoran la sencillez y quieren enviar facturas con una opción de pago clara. Si tu negocio factura importes altos o tiene muchos cobros mensuales, merece la pena comparar el coste total con Stripe, GoCardless u otra pasarela.
Para negocios en España, Square dispone de un proceso de activación de VERI*FACTU cuando se usa como sistema principal de facturación. Si lo utilizas solo para procesar pagos y otro software genera tus facturas, el propio proveedor indica que el cumplimiento fiscal se gestiona desde ese sistema externo.
Si sueles enviar documentos o avisos por móvil, también te puede servir nuestra guía sobre cómo cobrar por WhatsApp con un enlace de pago.
Puntos fuertes: entrada sencilla, plan de facturación sin cuota mensual, recurrentes y recordatorios. Limitación principal: la comisión porcentual puede pesar en facturas grandes.
Antes de elegirla como herramienta principal, consulta nuestra review de Facturas Square.
TeamSystem Facturas: la mejor para autónomos que priorizan facturación adaptada a España
TeamSystem Facturas —la evolución de Billin— es un software de facturación pensado para autónomos y pymes que quieren emitir, enviar y seguir facturas sin montar un sistema complejo. Incluye facturas recurrentes, recordatorios, app móvil y envío por distintos canales. Además, el proveedor indica que integra pasarelas para que el cliente pueda pagar desde la propia factura.
Su plan Básico parte de 6,60 € + IVA al mes si se factura anualmente, o 8 € + IVA con facturación mensual. Hay una limitación relevante: ese plan está orientado a negocios pequeños y restringe, entre otras cosas, el número de clientes y productos; por eso el precio de entrada no debe analizarse sin mirar los límites del plan.
Lo recomendaríamos a autónomos, profesionales y microempresas que quieren poner orden en la facturación y automatizar recordatorios. Tiene más sentido si la emisión correcta de facturas pesa tanto como el cobro. Si tu prioridad es una infraestructura de pagos internacional o una API muy flexible, Stripe encaja mejor; si todos tus cobros son periódicos, GoCardless puede ser más especializado.
En materia de cumplimiento, TeamSystem publica que TS Facturas está adaptado a VERI*FACTU y ofrece acceso a su declaración responsable. Aun así, la obligación final depende de tu situación y de cómo utilices el sistema, por lo que merece la pena contrastar la configuración con la información de la Agencia Tributaria.
Si captas clientes fuera de tu web, la guía sobre cómo cobrar por redes sociales puede ayudarte a diseñar un flujo sencillo entre venta, factura y pago.
Puntos fuertes: enfoque muy claro en facturación para España, automatización y precio de entrada contenido. Limitaciones: el plan básico tiene límites y el coste final de cobrar online dependerá de la pasarela que conectes.
Para revisar con detalle planes, funciones y puntos débiles, consulta nuestra review de TeamSystem Facturas.
Conclusión: qué solución elegir para cobrar tus facturas online
No hay una herramienta ganadora para todos los negocios. Holded es nuestra opción más completa si quieres centralizar facturación, cobro y gestión; Stripe Invoicing encaja mejor cuando priorizas flexibilidad e integraciones; GoCardless destaca en cobros recurrentes; Square simplifica el inicio sin una cuota mensual de facturación; y TeamSystem Facturas tiene mucho sentido para autónomos que quieren un software centrado en facturación española.
La decisión correcta sale de cuatro preguntas: cuánto facturas de media, cuántas operaciones cobras al mes, qué método prefiere tu cliente y si necesitas también emitir y gestionar la factura. Haz el cálculo con tu volumen real. Una diferencia de un punto porcentual son 10 € por cada 1.000 € cobrados, y a final de año puede pesar más que la cuota del software.
Nuestro consejo es no cambiar todo tu sistema por una función que ya puedes añadir. Si ya facturas bien, compara una pasarela o un enlace de pago. Si la facturación, los recordatorios y la conciliación te consumen horas, entonces sí puede merecer la pena pasar a una solución integral. Para un ecommerce, además, conviene revisar las mejores pasarelas de pago para ecommerce porque el flujo de compra es distinto al cobro de una factura de servicios.





















