Resumen rápido
- El IVA se liquida habitualmente mediante el modelo 303.
- Las empresas presentan el modelo por vía electrónica; determinadas sociedades, entre ellas las SA y SL, deben utilizar certificado electrónico reconocido.
- Si sale a ingresar, puedes elegir entre domiciliación, cargo en cuenta, tarjeta, Bizum y determinadas transferencias.
- Si pagas mediante cargo en cuenta, tarjeta o Bizum, se genera un NRC, que identifica el ingreso realizado.
- Pagar y presentar no siempre son el mismo paso: comprueba que tienes los dos justificantes.
- Nuestra opción recomendada si buscas una solución bancaria para centralizar la operativa fiscal de una empresa es Bankinter Empresas, que permite gestionar pagos de impuestos desde su banca para empresas.
Cómo pagar el IVA de una empresa online paso a paso
1. Accede al modelo 303 de la Agencia Tributaria
Entra en la Sede electrónica y accede a la presentación del modelo 303. La AEAT dispone además del servicio Pre303 para ayudar a confeccionar y presentar la autoliquidación.
Puedes ir directamente al modelo 303 y servicio de presentación de la Agencia Tributaria.
Para una sociedad, asegúrate antes de empezar de que tienes disponible el certificado electrónico correspondiente o que la persona que realiza el trámite está correctamente autorizada.
Si gestionas también actividad como profesional por cuenta propia, en nuestra sección de autónomos encontrarás otras guías relacionadas con la gestión diaria del negocio.
2. Comprueba que el resultado es “a ingresar”
Una vez cumplimentado el modelo, la declaración puede dar distintos resultados. Para este artículo nos interesa el caso en el que la casilla de resultado sea positiva y, por tanto, exista una cantidad que pagar. La propia AEAT denomina este resultado declaración “a ingresar”.
No hace falta complicar aquí el cálculo del IVA: básicamente, en régimen general se parte del IVA repercutido y del IVA soportado que realmente sea deducible.
Ejemplo práctico: imagina que, tras completar correctamente el modelo 303, el resultado de tu empresa es de 1.250 € a ingresar. Esa es la cantidad que tendrás que abonar mediante una de las formas de pago admitidas.
Ojo con una confusión frecuente: que un gasto sea fiscalmente deducible no significa automáticamente que todo su IVA lo sea en cualquier circunstancia. Por ejemplo, si estás revisando gastos como un espacio de trabajo, puedes consultar nuestra guía sobre deducir el coworking siendo autónomo, pero conviene analizar por separado los requisitos de deducibilidad del IVA.
3. Elige cómo quieres pagar el IVA
Estas son las principales alternativas disponibles por internet:
| Forma de pago | Cuándo suele tener más sentido |
|---|---|
| Domiciliación bancaria | Si presentas dentro del plazo específico de domiciliación y quieres que Hacienda realice el cargo automáticamente |
| Cargo en cuenta | Si quieres pagar en ese momento desde una entidad colaboradora y obtener el NRC |
| Tarjeta o Bizum | Si el modelo admite esta modalidad y prefieres realizar el pago directamente desde la pasarela de la AEAT |
| Transferencia | Principalmente cuando utilizas una cuenta de una entidad que no es colaboradora de la AEAT |
La Agencia Tributaria mantiene una guía específica con las formas de pago de impuestos y autoliquidaciones por internet.
Domiciliar el IVA
La domiciliación es cómoda porque no necesitas realizar manualmente el pago el último día. Indicas el IBAN al presentar la declaración y la Agencia Tributaria tramita el cargo.
Tiene una limitación importante: el plazo para domiciliar suele terminar antes que el plazo general para presentar el modelo 303. Por eso no conviene esperar hasta el último día.
Puedes consultar las fechas aplicables en el calendario oficial del contribuyente de la Agencia Tributaria.
Pagar mediante cargo en cuenta y obtener un NRC
También puedes realizar el ingreso desde la pasarela de la AEAT. Introduces los datos de la autoliquidación y el IBAN correspondiente y, cuando el pago se procesa correctamente, obtienes un NRC de 22 caracteres que identifica ese ingreso.
Guárdalo junto con el justificante.
Error común: pagar el impuesto, ver el cargo en el banco y pensar que el trámite ha terminado. Si has obtenido un NRC para una autoliquidación, debes comprobar después que el modelo 303 también se ha presentado correctamente.
Pagar el IVA con tarjeta o Bizum
El modelo 303 se encuentra entre los modelos para los que la AEAT permite utilizar su pasarela de pago con tarjeta o Bizum. Al finalizar correctamente también se genera el NRC correspondiente.
Antes de confirmar, revisa especialmente el NIF, el modelo, el periodo y el importe. Un error aquí puede complicar bastante más la gestión que dedicar un minuto adicional a comprobar los datos.
4. Presenta el modelo y descarga los justificantes
Si has realizado primero el pago y obtenido el NRC, vuelve al proceso de presentación del modelo e incorpora el código cuando corresponda.
Al terminar, deberías conservar como mínimo:
- El justificante del pago.
- El NRC, cuando se haya generado.
- El justificante de presentación del modelo 303.
Guardar esta documentación ordenada te facilitará después la conciliación bancaria y cualquier comprobación. También es una buena práctica separar el dinero reservado para impuestos del efectivo que la empresa necesita para funcionar. En nuestra guía de ahorro en empresas explicamos otras formas de reforzar ese colchón financiero.
¿Se puede pagar el IVA desde la banca online de la empresa?
Sí. Además de iniciar el proceso desde la Agencia Tributaria, algunas entidades permiten gestionar impuestos desde su propia banca online y obtener el NRC necesario.
Aquí Bankinter Empresas es nuestra opción recomendada si quieres centralizar este tipo de operativa. Bankinter indica que desde su web para empresas permite realizar pagos de tributos de la AEAT, domiciliar impuestos y consultar el histórico de pagos realizados.
Puedes consultar primero nuestro análisis de Bankinter Empresas y, si encaja con las necesidades de tu negocio, acceder a Bankinter Empresas desde aquí.
No necesitas cambiar de banco únicamente para presentar el IVA. La ventaja está en valorar el conjunto de la operativa: pagos fiscales, transferencias, gestión diaria y control de tesorería. Antes de decidir, puedes comparar también los mejores bancos y cuentas para empresas y revisar qué necesitas para abrir una cuenta de empresa en Bankinter.
Cuándo hay que pagar el IVA de una empresa
Si tu empresa presenta el modelo 303 trimestralmente, el plazo general de presentación es:
- Primer trimestre: del 1 al 20 de abril.
- Segundo trimestre: del 1 al 20 de julio.
- Tercer trimestre: del 1 al 20 de octubre.
- Cuarto trimestre: del 1 al 30 de enero.
Cuando el último día es inhábil, el vencimiento se desplaza al siguiente día hábil. Las declaraciones mensuales siguen otro calendario.
Recuerda además que domiciliar tiene sus propios plazos, normalmente más cortos que los de presentación. Si vas justo de caja, anticipar estas fechas dentro de tu planificación de tesorería para pymes y autónomos es bastante más útil que intentar resolver el problema el día del vencimiento.
Errores que conviene evitar al pagar el IVA online
El primero es equivocarse en el periodo o en el importe al obtener el NRC. El NRC incorpora información del NIF, importe, modelo, ejercicio y periodo, así que esos datos deben coincidir con la declaración.
El segundo es esperar al último momento. Un problema con el certificado, una autorización pendiente o una incidencia bancaria puede dejarte sin margen.
El tercero es gastar durante el trimestre todo el dinero cobrado a clientes sin reservar liquidez para impuestos. El IVA repercutido no debería confundirse con dinero disponible libremente para otros gastos del negocio.
Consejo Finantres: intenta revisar periódicamente la previsión del modelo 303 y separar la cantidad aproximada que tendrás que ingresar. Y si parte de tu problema está en que tus clientes pagan tarde, mejorar procesos como el cobro de facturas a distancia puede ayudarte a reducir tensiones de caja.
Conclusión
Pagar el IVA de una empresa por internet es bastante directo cuando tienes preparados el certificado, el modelo 303 y la cuenta desde la que realizarás el ingreso. La vía más sencilla suele ser presentar desde la Agencia Tributaria y utilizar domiciliación o su pasarela de pago, comprobando siempre que el proceso termina con el pago y la presentación correctamente registrados.
Si además quieres tener impuestos y tesorería empresarial más centralizados, Bankinter Empresas es una opción que recomendamos valorar por su operativa online específica para el pago de tributos. No elijas una cuenta solo por esta función: revisa primero si el conjunto de servicios encaja con la operativa real de tu empresa.
















